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微生物絕對定量

反映微生物真實數量及差異

微生物絕對定量簡介

常規的相對豐度分析忽略了不同樣本之間總體微生物量存在的現實差異,造成了分析結果的偏差。而絕對定量分析則是計量樣本每種微生物的16S基因拷貝數或者細胞數目,從而實現絕對定量,因此相對于常規16S相對定量擴增子測序,絕對定量分析能反映樣本每種微生物的真實數量和組間樣本的真實差異。

微生物/16S/細菌/擴增子絕對定量
相對豐度分析無法準確反映樣本中的真實微生物量

微生物絕對定量發展

微生物絕對定量發展

百邁客微生物絕對定量介紹

百邁客運用高通量測序技術和spike-in內標法實現對細菌的絕對定量。通過在樣品中加入已知拷貝數的spike-in內參序列,與樣品同時進行擴增、建庫測序,然后通過內參的理論拷貝數與測序tags數,繪制標準曲線,結合標準曲線及樣品的組織、核酸、擴增用量等計算得到OTUs/ASVs的絕對拷貝數表。能夠一次獲得所有細菌的絕對定量結果,包括總豐度和每種菌的豐度。

百邁客微生物絕對定量技術路線

百邁客微生物絕對定量技術路線

百邁客微生物絕對定量產品類型

產品類型

產品類型 支持區域 數據量 分析內容
細菌絕對定量(三代) 16S全長 1W CCS 常規擴增子分析+絕對定量
細菌絕對定量(二代) 16S V3-V4,16S V4 5W tags 常規擴增子分析+絕對定量

送樣量

組織類型 送樣量
土壤 1~2g
糞便 0.5~2g

備注:上述組織送樣量均為三次提取的量

百邁客微生物絕對定量產品優勢

技術成熟

技術成熟

Nature頂刊曾發文,運用范圍廣,土壤、糞便、腸道菌群皆可適用。

性價比高

性價比高

一次測序能夠獲得兩份報告,絕對定量+相對定量結果。

種水平定量

種水平定量

結合三代絕對定量測序能夠實現種水平絕對定量。

數據準確

數據準確

經rrnDB數據矯正,16s rRNA基因拷貝數更接近細胞數。

微生物絕對定量應用場景

微生物絕對定量案例分享
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